Hola Óscar,
Para asociar el almacén por defecto en la plantilla, debes colocar el código del mismo en la columna "Default Warehouse" (adjunto imagen).
En el caso de las ubicaciones estándar, no tengo conocimiento de como subir esa información por plantilla. Solamente lo he realizado desde SAP de forma manual.
Si es tu caso, puedes realizarlo por Grupo de Artículo para que la asociación sea más sencilla.
Espero haberte ayudado.
Saludos